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El territorio neuquino se incorporó a la Nación en forma definitiva después de la Campaña al Desierto de 1879, dirigida por el General Julio Argentino Roca. El primer gobernador del territorio fue el Coronel Manuel José Olascoaga.
Durante los dos períodos de gobierno (1884-1890) el coronel Olascoaga, sentó las bases de la organización administrativa, implementó el funcionamiento de la Policía y puestos fronterizos, creó Juzgados de Paz y oficinas de Correos y Telégrafos. A pesar de esto el gobernador territorial no llegó a ver concretadas las comunicaciones en el territorio neuquino. Después de su gestión, a fines de 1890, se evidenciaron los problemas administrativos y socioeconómicos, la falta de medios de comunicación y la geografía accidentada fueron detonantes. Fue designada como capital territorial la localidad de Chos Malal por decreto del Poder Ejecutivo Nacional del 14 de Mayo de 1888.
Al asumir sus funciones como Gobernador del Territorio Nacional del Neuquén, Don Carlos Bouquet Roldán (1903- 1906), luego del reconocimiento del territorio, propone la idea de trasladar la capital desde Chos Malal al poblado ubicado en la margen derecha del río Neuquén, paraje genéricamente llamado Confluencia. La naciente localidad se constituye paulatinamente en boca de salida de los productos que se comercializaban fuera de Neuquén, a través del ferrocarril. Es por esto que Bouquet Roldán viaja a la Capital Federal y se entrevista con el entonces Ministro del Interior Joaquín V. González, convencido de los beneficios del traslado de la capital. Es así como por un Decreto del poder Ejecutivo Nacional, del 19 de Mayo de 1904 se fija la división del Territorio del Neuquén en doce departamentos y se establece que Chos Malal conservaría provisionalmente su carácter de capital hasta el traslado de las autoridades neuquinas hasta el paraje Confluencia, el cual pasaría a denominarse Neuquén.

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